Συγκεκριμένα, την άνοιξη του '13 ο πρόεδρος του Παναθηναϊκού είχε επικοινωνήσει με τον πρώην άσο του Παναθηναϊκού και του είχε προτείνει την θέση του τεχνικού διευθυντή, με τον Φύσσα να ευχαριστεί για την πρόταση αλλά να αρνείται καθώς είχε υποχρεώσεις με το αντιπροσωπευτικό συγκρότημα.
Ωστόσο, η συμπεριφορά του κέρδισε τον Γιάννη Αλαφούζο που του είχε πει "όποτε φύγεις από την Εθνική, η πόρτα του Παναθηναϊκού θα είναι ανοικτή για σένα". Γι’ αυτό τον λόγο πριν από λίγες μέρες ο πρόεδρος του Τριφυλλιού έσπευσε να του προτείνει θέση στο οργανόγραμμα της ΠΑΕ, λέγοντας στους συνεργάτες του ότι "είναι μια επιλογή που δεν έπρεπε να χαθεί για την οικογένεια του Παναθηναϊκού".
Αξίζει να σημειωθεί ότι η τελική πρόταση που του έγινε αφορά πολύ διευρυμένες δραστηριότητες σε σχέση με αυτή που του είχε κατατεθεί πριν από δύο εβδομάδες περίπου.
