Παράλληλα, όσα συμβαίνουν τον τελευταίο καιρό στα διοικητικά του Παναθηναϊκού δεν μπορούσαν να τον αφήσουν ανεπηρέαστο. Βλέποντας πως το «τριφύλλι» μένει χωρίς διοίκηση και την ατμόσφαιρα που επικρατεί γύρω από την ομάδα δεν μπορούσε να προχωρήσει, χωρίς αυτό να έχει να κάνει με το ποδοσφαιρικό τμήμα, αλλά κυρίως με τη συσπείρωση που δεν είχαν οι «πράσινοι».
Επιπλέον, η διάψευση της ΠΑΕ για την άποψη του Ζεσουάλδο Φερέιρα και του Κάρλος Φρέιτας για τις μεταγραφές (είχαν αναφερθεί σε λύσεις που θα ήθελαν, αλλά λόγω της κατάστασης δεν μπορούν να υλοποιηθούν), δεν βρήκε σύμφωνο τον Κάρλος Φρέιτας, ο οποίος δεν διέψευσε ποτέ αυτό που ειπώθηκε.
Τέλος, τα διάφορα δημοσιεύματα τα οποία τον ήθελαν υπεύθυνο για την εικόνα του Παναθηναϊκού έπαιξαν τον ρόλο τους, ωστόσο δεν ήταν η μοναδική αιτία αποχώρησής του, όπως έχει βγει προς τα έξω. Εξάλλου, δεν ήταν μόνο ο Φρέιτας στην Παιανία και θεωρούσε άδικο όλο αυτό που γινόταν από τα Μέσα.
